Полiт.ua Государственная сеть Государственные люди Войти
6 декабря 2016, вторник, 21:00
Facebook Twitter LiveJournal VK.com RSS

НОВОСТИ

СТАТЬИ

АВТОРЫ

ЛЕКЦИИ

PRO SCIENCE

ТЕАТР

РЕГИОНЫ

Константин Попадьин

#ЗНАТЬ. «По-моему, я все время был в науке»

Константин Попадьин
Константин Попадьин
Фото: Наташа Четверикова/polit.ru

В преддверии лекции 6 декабря в рамках Фестиваля Публичных лекций #ЗНАТЬ мы побеседовали с биологом, научным сотрудником Института проблем передачи информации РАН Константином Попадьиным.

Как вы пришли в науку?

Я даже не помню. По-моему, я все время был в науке. В детстве я во всякие кружки ходил – экологические, биологические. Дед мой любил выращивать всякие редкие растения. Я участвовал в олимпиадах начиная с седьмого класса. В школе я сразу полюбил биологию, экологию – вообще все науки, но биологию и экологию больше. Поэтому, наверное, большого выбора у меня не было. Я начал участвовать в олимпиадах, стал занимать хорошие места, ездил по разным городам. Это все мне было интересно. И, наверное, уже тогда я сильно не задумывался, куда идти. Я хотел в какой-то университет, где есть биология. Конечно, было много выбора – МГУ, не МГУ. Но начиная со второй половины старшей школы, я более или менее понимал, что я хочу изучать биологию. Всякие детали определялись еще долго, до сих пор определяются. Я прыгаю из одной области в другую, но, по крайней мере, общее направление остается.

Интерес к биологии сформировался благодаря школе или помимо школы?

Сложно сказать. Я не могу сказать, что у меня были очень хорошие учителя, которые бы меня сильно заинтересовывали биологией. Я, честно говоря, не знаю, почему мне так понравилась в последних классах школы биология. Возможно, я прочитал несколько хороших книжек, что-то типа «Эгоистичного гена» Докинза – такие популярные книжки, которые многих завлекают. Но я не ассоциирую это с какими-то конкретными людьми или учителями. Пожалуй, кружок. Я родился в Рязани. В Рязани был Дом пионеров, и в нем был биологический кружок. И там мы делали разные вещи – считали, сколько лишайников на дереве, придумывали, почему они отличаются и так далее. В общем, мы ходили по городу, все изучали, пытались объяснить. Это было интересно. И может быть, это было одним из таких важных событий, которые меня подтолкнули идти дальше в биологию, экологию. Возможно, да. Кружок в Доме пионеров. Сейчас это называется Дворец детского творчества, раньше это был Дом пионеров.

Что было после того, как вы поступили в университет?

Я очень долго выбирал конкретную область. В университет я поступил на биофак МГУ на одно отделение (там есть несколько отделений). Одно более натуралистичное – зоолого-ботаническое. Другое более молекулярное. Я поступил на молекулярное. Долго ходил, мучился, думал, что же мне делать на этом молекулярном отделении. После первого года на этом отделении я перевелся на другое отделение, зоолого-ботаническое, немало удивив всех, потому что молекулярное было более престижным и сложным. Я что-то искал, сам не понимал что. Я беседовал с профессорами, приставал ко всем, просил советов и в итоге перешел на это более натуралистичное отделение, где зоология и ботаника, классические науки, были основными. Молекулярную биологию, генетику люди изучали не так глубоко.

А потом все равно, будучи на зоолого-ботаническом отделении, закончив кафедру зоологии позвоночных (очень хорошая кафедра, мне очень нравится), стал заниматься в итоге генетикой, молекулярной биологией, но на другом уровне. На уровне компьютерной генетики, на уровне биоинформатики. То есть далее у меня довольно часто менялись темы, я пытался изучать одну область, потому другую, более генетическую, более эволюционную. И до сих пор я сижу как будто на двух стульях, даже между тремя стульями. У меня все проекты связаны с классической генетикой, с анализом геномов, с экологией. У меня есть такой экологический бэкграунд, и эволюция. Между этими тремя науками есть много проблем, много интересных вопросов. Когда у тебя есть возможность проверить эволюционные гипотезы, имея в руках и изучая как экологические данные, так и генетические, у тебя просто больше степеней свободы. Ты можешь больше придумать и проверить всяких гипотез. То есть эта область мне нравится до сих пор. И многие статьи, многие проекты я делаю на стыке эволюции, экологии и генетики. Это отражает мои блуждания по наукам, мои переходы с одного отделения на другое, поиск тем.

Почему вы решили в своей грядущей лекции рассказать о «молодых и старых генах в геноме человека»?

Выбор темы на лекцию был достаточно тривиальным и рациональным. Это то, чем я плотно занимался последний год. Просто сейчас эта тема, эта область в голове, в оперативной памяти. Мне достаточно быстро собрать всю интересную, более или менее популярную информацию, чтобы прочитать лекцию. Наверное, в среднем, раз в год, как и любой, наверное, ученый, я немного меняю темы, перехожу на новые проекты. И последний проект, созревший, который сидит у меня в оперативной памяти в голове – это возраст генов в нашем геноме. В этой теме всегда можно найти что-то интересное для широкой публики. Поэтому это то, что, как это ни пошло звучит, что мне легче всего будет интересно рассказать широкой аудитории. Я думаю, в следующем году возраст генов у меня уже не будет приоритетным направлением. А сейчас это проще и интереснее из всего, что я смогу рассказать.

Когда вы начали заниматься биоинформатикой?

Знаете, биоинформатика – достаточно большая наука, я думаю, я ее всю не знаю. Я занимался маленьким ее кусочком, сравнивал геномы разных зверей, пытался понять, почему они разные. И примерно этим я занимаюсь и сейчас. Просто сравниваю не только геномы, но и траскриптомы, то есть не только ДНК, но и то, как каждый ген интенсивно работает, скажем так. Один сильно работает, другой слабо экспрессируется, как мы это называем. И вместо разных зверей, разных млекопитающих, сейчас я сосредоточился на разных людях. Анализирую изменчивость внутри человеческой популяции. Но, в общем-то, я знаю этот маленький и не очень репрезентативный кусочек биоинформатики. Я себя в биоинформатике ощущаю юзером. Я использую много существующих программ, я пишу простенькие свои программки, скрипты.

А на каких языках пишете скрипты?

В основном это PERL и язык R, статистический язык. И на самом деле 95% времени я работаю на языке R и 5% времени на языке PERL.

Используя R, вы ведь фактически привязаны к данным довольно ограниченного объема?

Да. R любит все держать в оперативной памяти, и есть проблема, поэтому приходится пользоваться и другими программками. Вообще очень хорошо, выгодно иногда коллаборировать с лабораториям, которые занимаются какой-то областью, например, изучают транскриптомы людей, уровень экспрессии каждого гена. От них можно получить данные высокого качества, мы это называем метаданными. То есть большие таблицы, которые уже как-то обработаны, - это уже не совсем сырые данные эксперимента. Это уже высокого качества промежуточные данные. Соответственно, их меньше уже будет, то бишь, многие анализы можно гонять даже на ноутбуке. И они уже качественные и чистые. То есть можно сказать, что ты снимаешь сливки с хороших результатов, которые были получены для каких-то других целей, более функциональных генетических целей. Имея доступ к таким данным, ты ставишь другие вопросы. Ты понимаешь, что имея эти данные, ты можешь решить другой вопрос, ты ставишь вопрос, пробуешь его решить.

Поэтому я не всегда я начинаю проект с каких-то очень сырых данных, когда я скачиваю уровень экспресии каждого гена или скорость эволюции, выравнивание, из каждого банка. То есть частенько я начинаю свой проект уже с хороших предобработанных данных, полученных в результате труда нескольких людей, результаты свежей публикации. Тогда ты уверен, что работаешь с данными хорошего качества, часто с уникальными данными, если ничего не опубликовано, а ты просто напросился иметь доступ к этим данным. Это помогает быть уверенным, что ты не анализируешь какой-то шум, которого очень много. Это помогает быть на волне. То есть когда ты анализируешь новые уникальные данные, это всегда более интересно и более выгодно, скажем так.

Продолжение следует 

Обсудите в соцсетях


ПОДГОТОВКА ИНТЕРВЬЮ: Анна Сакоян
Система Orphus

Главные новости

20:42 Кабмин предложил внести кибератаки и хакерство в УК
20:29 ЦСКА подтвердил предстоящий уход Слуцкого с поста главного тренера
20:00 СМИ узнали об очередном приговоре за госизмену из-за СМС
19:57 Меркель призвала пересмотреть отношения с Россией и НАТО
19:42 Samsung согласился пойти на мировую с «Евросетью»
19:28 Хакеры взломали сайты минфина и казначейства Украины
18:57 France Football анонсировал присуждение Роналду «Золотого мяча»
18:47 ЕС запретил ввоз мяса птицы из Украины
18:29 Открыт астероид размером два метра
18:28 МЧС и Минобороны возглавили рейтинг наиболее «открытых» ведомств России
18:21 Глава ХМАО отстранила от должности директора спортшколы после ДТП
17:54 Медведев заявил о скорой ратификации РФ соглашения по «Турецкому потоку»
17:51 Над Хакасией взорвался метеорит
17:33 В Раде предложили вернуть Украине статус ядерной державы
17:31 Порошенко заявил о сотнях танков РФ в Донбассе
17:21 Против директора спортшколы возбуждено дело после ДТП в ХМАО
17:11 Суд Кирова отказал прокуратуре в принудительном приводе Навального
17:01 Канцлер ФРГ предложила запретить в Германии ношение паранджи
16:51 Скончался актер из «Игры престолов»
16:38 Фигурантам дела о ДТП в ХМАО предъявлены обвинения
16:24 СМИ сообщили о желании Джоли стать генсеком ООН
16:15 Путин назвал идиотским решение Литвы не пустить судей КС на конференцию
16:02 Прокуратура признала пропажу двух свидетелей по делу Немцова
15:51 В Доме болельщиков «Локомотива» прошли обыски по делу об экстремизме
15:35 Правозащитник «Открытой России» подал в суд на ФСБ из-за командировки на войну с Грузией
15:15 Суд отказал защите в вызове Кадырова на допрос по делу об убийстве Немцова
15:14 Крымский Владимир Путин отказался менять фамилию за новый iPhone
15:03 Компания Comindware автоматизирует работу ООН
14:58 Плазма спасет от «желудочного гриппа»
14:54 По делу о ДТП с детьми в ХМАО задержана директор спортшколы
14:47 В Петербурге школьник скончался после урока физкультуры
14:32 Суд приостановил дело по жалобе Google против ФАС
14:29 Верховный суд Польши отказался выдать Полански властям США
14:17 Суд освободил счета IKEA от ареста
14:14 Белорусские провайдеры начали блокировать Tor
13:49 Песков заверил историков в безопасности новой доктрины информбезопасности
13:34 Геремеев вызван в суд по делу об убийстве Немцова
13:33 Убивший приемных родителей-итальянцев россиянин совершил суицид
13:27 Независимые эксперты сравнили медицину в РФ со странами третьего мира
13:25 Мутко рассказал о новой атаке на спорт РФ
13:18 Леди Гага рассказала о своем заболевании
13:06 Созданы нанопроволоки из ДНК и серебра
13:02 Песков отказался называть встречи Путина с народом предвыборной кампанией
12:46 Соцсети и YouTube объявили о создании реестра террористического контента
12:39 США отозвали предложения по ситуации в Алеппо для России
12:11 Бернар Казнёв назначен новым премьер-министром Франции
12:02 СМИ сообщили имена погибших в Алеппо медсестер
11:59 Глава минфина Украины опроверг необходимость переноса «Евровидения»
11:45 СМИ рассказали о погибших в Сирии медсестрах из России
11:44 Минэнерго подтвердило участие Новака во встрече ОПЕК в Вене
Apple Boeing Facebook Google NATO PRO SCIENCE видео ProScience Театр Pussy Riot Twitter аварии на железной дороге авиакатастрофа Австралия автопром Азербайджан Александр Лукашенко Алексей Навальный алкоголь амнистия Анатолий Сердюков Ангела Меркель Антимайдан Армения армия Арсений Яценюк археология астрономия атомная энергия Афганистан Аэрофлот банковский сектор Барак Обама Башар Асад беженцы Белоруссия беспорядки бизнес биология ближневосточный конфликт болельщики «болотное дело» Борис Немцов Бразилия Великая Отечественная война Великобритания Венесуэла Верховная Рада взрыв взятка видеозаписи публичных лекций «Полит.ру» видео «Полит.ру» визовый режим Виктор Янукович «ВКонтакте» ВКС Владимир Жириновский Владимир Путин ВМФ военная авиация Вторая мировая война вузы выборы выборы губернаторов выборы мэра Москвы газовая промышленность «Газпром» генетика Генпрокуратура Германия ГИБДД гомосексуализм госбюджет Госдеп Госдума гражданская авиация Греция Гринпис Грузия гуманитарная помощь гуманитарные и социальные науки Дагестан Дальний Восток День Победы дети Дмитрий Медведев Дмитрий Песков Дмитрий Рогозин доллар Домодедово Донецк драка ДТП Евгения Васильева евро Евромайдан Евросоюз Египет ЕГЭ «Единая Россия» Екатеринбург естественные и точные науки ЖКХ журналисты закон об «иностранных агентах» законотворчество здравоохранение в России землетрясение «Зенит» Израиль Индия Индонезия инновации Интервью ученых интернет инфляция Ирак Ирак после войны Иран Иркутская область ислам «Исламское государство» Испания история История человечества Италия Йемен Казань Казахстан Канада Киев кино Китай Климат Земли, атмосферные явления КНДР Книга. Знание кораблекрушение коррупция космос КПРФ кража Краснодарский край кредиты Кремль крушение вертолета Крым крымский кризис культура Латвия ЛГБТ ЛДПР лесные пожары Ливия Литва литература Луганск Малайзия МВД МВФ медиа медицина междисциплинарные исследования Мексика Мемория метро мигранты МИД России Минздрав Минкульт Минобороны Минобрнауки Минфин Минэкономразвития Минюст мировой экономический кризис «Мистраль» Михаил Саакашвили Михаил Ходорковский МКС Молдавия Мосгорсуд Москва Московская область мошенничество музыка МЧС наводнение налоги нанотехнологии наркотики НАСА наука Наука в современной России «Нафтогаз Украины» некролог Нерусский бунт нефть Нигерия Нидерланды Нобелевская премия Новосибирск Новые технологии, инновации Нью-Йорк «Оборонсервис» образование ОБСЕ общественный транспорт общество ограбление Одесса Олимпийские игры ООН оппозиция опросы оружие отставки-назначения Пакистан Палестинская автономия пенсионная реформа Пентагон Петр Порошенко погранвойска пожар полиция Польша правительство Право «Правый сектор» преступления полицейских преступность происшествия публичные лекции Рамзан Кадыров РАН Революция в Киргизии рейтинги религия Реформа армии РЖД Роскомнадзор Роскосмос Роспотребнадзор Россельхознадзор Российская академия наук Россия Ростовская область РПЦ рубль русские националисты Санкт-Петербург санкции Саудовская Аравия Сбербанк связь связь и телекоммуникации Севастополь сельское хозяйство сепаратизм Сергей Лавров Сергей Собянин Сергей Шойгу Сирия Сколково Славянск Следственный комитет следствие Совет Федерации социальные сети Социология в России Сочи Сочи 2014 «Спартак» «Справедливая Россия» спутники СССР стихийные бедствия Стихотворения на случай стрельба суды суицид США Таиланд Татарстан театр телевидение теракт терроризм технологии транспорт туризм Турция тюрьмы и колонии убийство Украина Федеральная миграционная служба физика Финляндия ФИФА фондовая биржа Фоторепортаж Франсуа Олланд Франция ФСБ ФСИН ФСКН футбол Хабаровский край хакеры Харьков химическое оружие хоккей Центробанк Цикл бесед "Взрослые люди" Челябинская область Чечня шахты Швейцария Швеция школа шпионаж Эбола Эдвард Сноуден экология экономика экономический кризис экстремизм Южная Корея ЮКОС Юлия Тимошенко ядерное оружие Япония

Редакция

Электронная почта: politru.edit1@gmail.com
Адрес: 129343, Москва, проезд Серебрякова, д.2, корп.1, 9 этаж.
Телефоны: +7 495 980 1893, +7 495 980 1894.
Стоимость услуг Полит.ру
Свидетельство о регистрации средства массовой информации
Эл. № 77-8425 от 1 декабря 2003г. Выдано министерством
Российской Федерации по делам печати, телерадиовещания и
средств массовой информации. Выходит с 21 февраля 1998 года.
При любом использовании материалов веб-сайта ссылка на Полит.ру обязательна.
При перепечатке в Интернете обязательна гиперссылка polit.ru.
Все права защищены и охраняются законом.
© Полит.ру, 1998–2014.