Владимир Пастернакций — сын священника из сел Дудичи Игуменского уезда Минской губернии. С детских лет Владимир прислуживал за богослужением и пел в церковном хоре. В 1908 году 23-летний Владимир Пастернацкий окончил Минскую духовную семинарию, женился. В семье было пять детей.
В 1908 году был рукоположен во священника ко храму первоверховных апостолов Петра и Павла в селе Песочное Слуцкого уезда, где служил его тесть, который в это время тяжело заболел, слег и в течение семи лет, до самой смерти, не поднимался с постели. В этом храме отец Владимир прослужил до 1932 года.
В 1920-х годах он был назначен благочинным церквей Копыльского района и возведен в сан протоиерея.
После 1928 г. старшие дети о.Владимира уже жили отдельно от родителей, стараясь, кто чем мог, помогать им, т.к. налоги, возложенные на семью священника были непомерно велики. В 1931 году семье священника было предложено заплатить налог, который был для них столь велик, что они не смогли собрать нужную сумму, и у них забрали корову.
В 1932 году отец Владимир был переведен в Спасо-Вознесенскую церковь в местечко Копыль (ныне Минская область).
В 1933 году все храмы в Копыльском районе были закрыты, а священники арестованы; оставалась лишь Спасо-Вознесенская церковь. Отца Владимира все чаще стали вызывать в НКВД и, угрожая расправой, требовать, чтобы он публично снял с себя сан. Взамен обещали обеспечить постоянной работой, например, в качестве бухгалтера, но священник это предложение категорически отверг. Власти, желая сломить его волю, потребовали от него упла ты такого налога, о котором заведомо знали, что уплатить его свя щенник не сможет, и исключили из школы его детей. На семейном совете священник, поддержанный супругой, сказал детям: «Бог послал нам это испытание, и мы его должны безропотно нести». Оказавшись единственным священником в районе, отец Влади мир с утра до вечера ездил по требам, крестил новорожденных, от певал умерших.
За несколько дней до ареста о.Владимир похоронил мать. Накануне взятия под стражу он отслужил последнюю в своей жизни литургию.
В марте 1936 года он был арестован по обвинению в присвоении власти административного лица, так как он вел запись имен всех крещаемых и тех, кого пришлось отпевать. 24 марта 1936 года он был приговорен к двум годам заключения и отправлен в исправительно-трудовую колонию № 1 в селение Хальч Гомельской области.
Матушка осталась одна с тремя несовершеннолетними детьми без средств к существованию. Но помогали, кто чем мог, прихожане. В 1936 году она с детьми переехала в город Рославль Смоленской области.
В декабре 1937 года отца Владимира неожиданно досрочно освободили, и 12 декабря он приехал к семье. Однако через день он был вновь арестован по обвинению в том, что «вел активную контрреволюционную агитацию о вой не и гибели советской власти... о якобы существующем голоде в Советском Союзе и притеснении религии со стороны советской власти».
Был допрошен хозяин квартиры, где жила семья священника; на вопрос следователя, что ему известно о контрреволюционной деятельности священника, он ответил: «Пастернацкий среди нас проводил контрреволюционную агитацию, которая выражалась в том, что он говорил, что он сидел в тюрьме совершенно напрасно, что советская власть притесняет всех граждан, соблюдающих религиозные обряды, а особо попов всех сажает в тюрьмы».
23 декабря 1937 года следователь допросил отца Владимира, особенно интересуясь тем, чем занимался священник во время гражданской войны.
— В 1920 году в нашем местечке находились белополяки, 12 июня 1920 года во время отступления белополяков красные партизаны стреляли по автомобилю польского полковника. В ре зультате наше местечко было оцеплено польскими войсками, и белополяки взяли человек сорок крестьян заложниками, и вместе с этими крестьянами был взят и я. Когда я находился у белополяков, то у нас выпытывали, кто стрелял по автомобилю. После чего нас освободили.
— Следствием установлено, что вы являетесь агентом немец кой разведки, то есть имели тесную связь с немецкой комендату рой. Дайте правдивые показания.
— В 1918 году в местечке Песочное находились немецкие вой ска, и в моем доме в течение девяти месяцев находилась немец кая комендатура. Агентом немецкой разведки я не являлся и не являюсь.
— По показанию свидетелей вы достаточно изобличаетесь в том, что, будучи враждебно настроены по отношению к советской власти, среди окружающего населения проводили контрреволю ционную агитацию. Признаете ли себя в этом виновным?
— Виновным себя в предъявленном мне обвинении не признаю.
— Следствием установлено, что вы 13 декабря 1937 года, нахо дясь в квартире, где присутствовали хозяева данного дома и квар тиранты, среди них проводили контрреволюционную агитацию и говорили, что советская власть всех притесняет и не дает соблю дать религиозные обряды; говорили, что советская власть просуществует недолго, то есть явно предсказывали гибель советской власти. Признаете ли вы себя в этом виновным?
— Виновным себя в этом не признаю.
5 января 1938 года тройка УНКВД по Смоленской области приговорила отца Владимира к расстрелу.
Расстрелян 21 января 1938 года в 17 часов в Смоленской области. Погребен в общей безвестной могиле.