Иван Протопопов — крестьянский сын из Одессы. С 22 мая 1907 года 27-летний Иван Протопопов — послушник Феодосиевского мужского монастыря в городе Балта Подольской губернии.
27 ноября 1910 года пострижен в монашество с именем Иов епископом Балтским Амвросием (Гудко). Стал келейником епископа Амвросия, оставаясь в штате монастыря. 16 июня 1914 года перемещен в штат Сарапульского архиерейского дома, вслед за еп. Амвросием. 28 марта 1917 перешел в свияжский Успенский мужской монастырь, неотлучно оставаясь в качестве келейника при архиерее Амвросии (Гудко).
19 марта 1918 года рукоположен во иеродиакона епископом Амвросием.
После ареста епископа Амвросия о. Иов добился разрешения сопровождать архиерея. Находился с епископом Амвросием в тюрьме Казани. После освобождения они вместе вернулись в Свияжский монастырь, но вскоре были вновь арестованы.
Их вместе вывезли из Свияжска на станцию Тюрлема Московско-Казанской железной дороги. 9 августа 1918 года из штаба 5-й армии, стоявшего в вагонах поезда Троцкого, владыку Амвросия вывели в поле и убили, а келейника отпустили, запретив ему следовать за своим любимым епископом. Через несколько часов о.Иов нашел на поле тело умученного владыки Амвросия. Он похоронил владыку на месте его мученической кончины и в продолжении 12 лет платил крестьянину, владельцу поля, чтобы тот не трогал того места, где покоилось на небольшой глубине тело новомученика. В 1930 году земля отошла к колхозу, и в дальнейшем не удалось установить судьбу безвестной могилы владыки Амвросия.
С августа 1918 года перешел в Раифскую пустынь. Был рукоположен во иерея.
После закрытия монастыря в июне 1928 года служил в деревне Таганаш до декабря 1929 года, после чего поселился в деревне Бело-Безводная.
23 января 1930 года был арестован по обвинению в «антисоветской агитации» вместе с монахами бывшей Раифской обители. Проходил по групповому «делу Раифских монахов. Казань, 1930г.». Виновным себя не признал.
20 февраля 1930 года был осужден тройкой при постоянном представительстве ОГПУ Татарской АССР и приговорен к расстрелу вместе с преподобномучениками Антонием (Чирковым), Варлаамом (Похилюком), Иосифом (Гавриловым), послушником Петром Тупицыным, а также мирянами Василием Гавриловым и Степаном Абрамовым.
Расстрелян 7 апреля 1930 года с другими раифскими мучениками, погребен в общей безвестной могиле.
