Афанасий Милов родился в 1877 году селе Солдатском Нижнеломовского уезда Пензенской губернии. Закончил трехклассную школу в родном селе. До 1930 года служил священником в селе Щучьем (современный Мамлютский район Северо-Казахстанской области) и поддерживал отношения с причтом Никольской церкви города Петропавловска, сохранившим верность Православию во время распространения обновленчества.
С 1930 года жил в Кузнецке, в 1932 году переехал в село Прудки, затем вернулся в Щучье.
В 1937 году церковным советом был выдвинут в депутаты Верховного совета, но его кандидатура была отклонена колхозниками.
28 ноября 1937 года был арестован по обвинению в контрреволюционной деятельности, выразившейся в намерении «бойкотировать выборы в Верховный Совет». Виновным себя он не признал. На допросах он показал, что «...это выдвижение и агитация за мою кандидатуру было без моего ведома, я был поставлен перед фактом, что меня хотят выбрать». При общем собрании кандидатура о.Афанасия была отклонена колхозниками. «...слыша это, я промолчал». На вопрос — рассказать о своей контрреволюционной деятельности, о.Афанасий ответил: «Действительно верно, я открыто проповедовал на селе Евангельское учение. При встречах с гражданами, они жаловались, что плохо жить, я говорил, что время такое пришло, что надо терпеть, мне вот тоже пришлось на старости скитаться».
2 декабря 1937 года тройкой УНКВД Северо-Казахстанской области приговорен к расстрелу.
Расстрелян 5 декабря 1937 года. Погребен в безвестной могиле.
