Иван Попов — сын диакона из села Бурдукове Грязовецкого уезда Вологодской губернии. В 1883 году 20-летний Иван Попов окончил Вологодское духовное училище и 2 класса Вологодской духовной семинарии, по семейным обстоятельствам не смог продолжить обучение.
25 октября 1885 года назначен на должность псаломщика в Спасо-Преображенскую церковь села Шежам Яренского уезда Вологодской губернии. В 1889-1900 годах преподавал (не получая жалованья) церковное пение в айкинской земской школе при Шежамском приходе. 3 мая 1889 года посвящен в стихарь.
12 февраля 1901 года уволен «за нетрезвость и допущенные в таком виде беспорядки при совершении вечерни» и отправлен на 2 месяца на послушание в Коряжемский мужской монастырь.
30 мая 1901 года определен исполняющим должность псаломщика к Богородицкой церкви села Важкурья Усть-Сысольского уезда. 28 августа 1906 года утвержден в должности. Служил законоучителем и преподавателем пения в церковноприходской школе и земском училище села Важкурья. С мая 1903 по 1918 год был лектором народных чтений.
В 1922 году был рукоположен во иерея, служил в Иоанно-Предтеченской церкви села Керчомья Усть-Куломского уезда (с 1929 района) Коми (Зырян) автономной области. Последний священник в Керчомье в XX веке.
В 1932 году арестован по обвинению в сокрытии церковных ценностей, дело было закрыто за отсутствием состава преступления.
2 сентября 1937 года арестован по обвинению в «систематической контрреволюционной агитации против мероприятий советской власти, колхозного строительства, распространении клеветнических слухов, сожалении о расстреле врагов народа». Заключен в тюрьму Сыктывкара.
21 сентября 1937 года Особой тройкой при УНКВД Коми АССР приговорен к расстрелу.
Расстрелян 23 сентября 1937 года в окрестностях г. Сыктывкара.
