Европейский суд по правам человека (ЕСПЧ) признал, что в «деле ЮКОСа» была нарушена Конвенция о правах человека и право Ходорковского и Лебедева на справедливое судебное разбирательство (статья 6 Конвенции — право на справедливое судебное разбирательство — в частях (с) и (d)).Соответствующее решение опубликовано на сайте ЕСПЧ.
При этом суд отказался признать политическим преследование бизнесменов Михаила Ходорковского и Платона Лебедева.
Денежных компенсаций бизнесменам не назначили.
Ходорковского арестовали по обвинению в хищениях и неуплате налогов 25 октября 2003 года. В 2005 году его признали виновным в мошенничестве и других преступлениях, а в 2010 — в крупном хищении нефти и отмывании средств. Срок его содержания под стражей составил 10 лет и 10 месяцев.
Бизнесмен Платон Лебедев также отсидел 10,5 лет по первому и второму «делам ЮКОСа» — обвинению в хищениях, неуплате налогов, легализации похищенного.
В июне 2019 года Генпрокурор РФ Юрий Чайка подтвердил информацию о расследовании третьего уголовного дела в отношении бывшей нефтяной компании ЮКОС.
Международная правозащитная организация Amnesty International признала Лебедева и Ходорковского узниками совести, то есть людьми, которых посадили из-за их убеждений.