Дмитрий Рудаков — сын священника села Старый Покров Владимирской губернии, в 1889 году, десятилетним, окончил три класса духовного училища. С 1901 по 1914 год служил псаломщиком в храме села Галенищево Юрьевского района Московской области.
В 1914 году перешёл в приход храма Тихвинской иконы Божией Матери села Ивановское, где и служил до ареста. Первая жена его умерла, он женился на Татьяне, в 1919 году родилась дочь Надежда.
По воспоминаниям прихожан, примерно в 1930 году всем клирикам храма власти предложили публично отречься от веры. Настоятель храма протоиерей Сергий Руфицкий и псаломщик Дмитрий Рудаков категорически отказались. На сделку с властями пошёл диакон храма Николай: в клубе перед сельчанами он «покаялся», что обманывал их, ему обрезали длинные волосы и после этого он немедленно уехал из села.
После того как Дмитрий Рудаков отказался отречься от веры, семью раскулачили — отняли корову и лошадь, выгнали из дома, а самого Дмитрия в 1931 году судили и приговорили к трём годам лишения свободы. Сначала он несколько месяцев провёл в Покровской пересыльной тюрьме, а затем был выслан в Вологодскую область. Жена и дочь его мыкались по углам, но отец Сергий Руфицкий сумел устроить их в церковной сторожке и даже выправить им документы на проживание в ней. Затем Татьяне сказали, что можно отправить документы в Москву на пересмотр дела. Она так и поступила. Ходатайство было успешным, в деле были обнаружены нарушения, и приговор отменили. После полутора лет разлуки с близкими Дмитрий Рудаков вернулся домой и вновь стал служить псаломщиком в Тихвинском храме.
Гонения сблизили отца Сергия и Дмитрия Ивановича. Они много времени проводили вместе, службу в храме совершали неукоснительно. Близкие вспоминают, что церковная молитва в последние годы перед их арестом стала особенно сосредоточенной.
17 ноября 1937 года вечером после всенощного бдения священника и псаломщика арестовали. Очевидцы говорят, что, прежде чем сесть в «воронок», они перекрестились на храм и поклонились присутствующим односельчанам.
19 ноября 1937 года состоялся единственный допрос Дмитрия Рудакова.
— Обвиняемый Рудаков, следствие располагает данными, что вы, проживая в деревне Иваново, проводили антисоветскую агитацию в контрреволюционном духе. Подтверждаете ли вы это?
— Я это отрицаю, никогда никакой антисоветской агитации я не проводил.
Обвинений в контрреволюционной деятельности и антисоветской агитации он не признал.
21 ноября Тройка НКВД по Московской области по ст. 58-10 УК РСФСР приговорила протоиерея Сергия Руфицкого и псаломщика Димитрия Рудакова к расстрелу за «контрреволюционную агитацию».
27 ноября 1937 года Димитрий Рудаков расстрелян и погребен в безвестной общей могиле на полигоне Бутово.