Афанасий Мосалитинов — крестьянский сын из Крюковской волости Грайвороновского уезда Курской губернии. В августе 1901 г. 28-летний Афанасий Мосалитинов поступил послушником в Верхотурский Никольский мужской монастырь в г. ВерхотурьеПермской губ.
В 1904 г., с началом русско-японской войны, мобилизован в армию; после увольнения с военной службы в 1906 г. снова принят в число братии монастыря.
27 марта 1908 г. был пострижен в монашество. В 1910 году рукоположен во диакона, в 1913 году — во священника.
16 июля 1918 г. по требованию советских властей и благословению настоятеля монастыря архим. Ксенофонта (Медведева) о. Аполлинарий был назначен в Спасскую церковь села Красногорского Верхотурского уезда на место арестованного священника. В июле того же года батюшка отправился помолиться на могиле св. Симеона Верхотурского в Симеоновскую церковь села Меркушина, где и был арестован по обвинению в «антисоветской агитации» и отправлен в Верхотурье.
31 июля 1918 года заколот штыками в тюрьме на станции Карелино Пермской губернии, недалеко от Верхотурья, похоронен там же. После отступления большевиков тело о. Аполлинария в числе других жертв красного террора было перезахоронено на братском кладбище Николаевского монастыря.
