Михаил Кванин — крестьянский сын из села Губкино Малоархангельского уезда Орловской губернии. Окончил сельскую школу. Поступил послушником в Виленский Свято-Духов монастырь. С 1914 года (ему было тогда 39 лет) — монах (иеромонах?) Самарского Николаевского мужского монастыря.
С 1917 года служил при архиерейском доме в Таганроге. С 1920 года был причетником села Болохово Тульской губернии в сане иеромонаха. В 1923 году переехал в Москву и определен к Свято-Духовской церкви Даниловского кладбища. Позднее был возведен в сан архимандрита. В начале 1930-х упоминается в списке григорианцев Владимирской церкви на Лубянке.
Перед арестом определенного места службы не имел. Совершал панихиды на разных кладбищах, в том числе на Даниловском кладбище.
23 февраля 1933 был арестован в составе группы священников, служивших в Свято-Духовской церкви. Все они проходили по одному делу. 15 марта особым Совещанием при Коллегии ОГПУ архим. Митрофан был приговорен к трем годам высылки в Северный край. Прибыв на место высылки, архимандрит поселяется в Каргополе (возможный вариант: поселок Каргаполье Курганской области).
В 1936 году вернулся в Москву, был вновь арестован и приговорен к трем годам ссылки в Казахстан. Ссылку отбывал в селе Бородулиха Семипалатинской области.
22 ноября 1937 года был арестован Бельгачским райотделом НКВД, проходил по групповому делу «Дело протоиерея Дмитрия Куклина и др. г. Семипалатинск, 1937 г.» . Из обвинительного заключения: «Подрывал колхозный строй, агитировал за оформление группы верующих, вел пропаганду за соблюдение постов». Виновным себя не признал. 27 ноября 1937 года тройкой при УНКВД по Восточно-Казахстанской обл. был приговорен к расстрелу.
Расстрелян 2 декабря 1937 года в Семипалатинске. Место погребения его неизвестно.
