Наталья Бакланова — крестьянская дочь из села Шестово Подольского уезда Московской губернии. Восьми лет, в 1898 году, пошла в школу, по окончании ее помогала родителям по хозяйству. В 1903 году поступила послушницей в Новодевичий монастырь в Москве.
После закрытия монастыря (1922) осталась жить на его территории. Кельи были превращены в коммунальные квартиры, она работала сначала уборщицей, а когда пришлось покинуть стены разоренной обители, вместе с монастырскими послушницами, сестрами Евдокией и Анастасией Прошкиными, поселилась в поселке при станции Сходня под Москвой и работала у разных людей по хозяйству. В 1931 году устроилась уборщицей в Институт курортологии в Москве.
27 ноября 1937 года была арестована. Сотрудники института показали, что Наталья Бакланов всегда отказывалась от общественных поручений; если она и участвовала в работе, то исполняла только техническую работу, а общественной работы чуждалась, проявляя к ней враждебность, отказывалась ходить на собрания, говоря, что у них все собрания и собрания, а ей некогда ходить на собрания.
В качестве свидетеля был допрошен священник, служивший в храме в поселке, где жила инокиня; он показал:
«Мне о контрреволюционной деятельности бывших монашек... известно следующее: все три монашки... проживают вместе в одной квартире... между собой тесно связаны... Бакланова... говорила: „Ныне все против нас направлено, не дают нам свободно веровать в Бога...“ Бакланова... сказала, что в доме отдыха такая скука — все пропаганда и пропаганда, безбожие, книжек религиозных нет... Такие разговоры и подобное недовольство существующим положением... как разговор и недовольство контрреволюционного характера, слышал от каждой... монашки».
— Вы, находясь в тесной связи с попом Малиновским... и Анастасией и Евдокией Прошкиными, устраивали у себя сборища, где обсуждали контрреволюционные вопросы? Вели совместную контрреволюционную деятельность? — спросил следователь Наталью.
— Никогда мы контрреволюционных вопросов не обсуждали и никакой не вели контрреволюционной деятельности.
— Вы следствию даете неверные показания, следствие еще раз предлагает вам дать правдивые показания о том, что периодически вас посещает поп Малиновский, с которым вы обсуждали контрреволюционные вопросы, вели совместную контрреволюционную деятельность.
— У меня на дому Малиновский бывал, с ним беседовали, но во время наших бесед мы контрреволюционных вопросов не обсуждали и не вели с ним никакой контрреволюционной деятельности.
7 декабря 1937 года тройкой НКВД приговорена к восьми годам заключения в исправительно-трудовом лагере. Была отправлена в Сиблаг. 8 января 1938 года прибыла с этапом в Мариинск. Вскоре она заболела и была помещена в лагерную больницу в Мариинске.
Скончалась 31 марта 1938 года в лагерной больнице и была погребена в безвестной могиле.