В 1914 году, когда Афанасию Докукину исполнилось пятнадцать лет, он лишился отца и матери и перешел жить к тетке, тогда же он окончил второклассное училище и стал служить псаломщиком в храме в Фатежском уезде Курской губернии. В 1923 году митрополит Курский и Обоянский Назарий (Кириллов) рукоположил его в сан диакона к Михаило-Архангельской церкви в селе Линцы Фатежского района, а в 1925 году — во священника к Введенской церкви села Кочетно Льговского района.
В 1933 году о. Афанасия арестовали за неуплату налогов и приговорили к трем годам заключения в исправительно-трудовом лагере. Освободившись в 1935 году, он был направлен служить в храм в село Стариково Талдомского района Московской области, а в августе 1936 года переведен в Никольскую церковь в село Никульское, где служил до ареста.
3 сентября 1937 года сотрудник НКВД допросил одного из лжесвидетелей, пастуха местного колхоза, и он согласился подписать показания, необходимые НКВД. 4 сентября о. Афанасий был вызван в местное отделение милиции для допроса, но поскольку все сотрудники НКВД были заняты, его допросила паспортистка.
11 сентября священник все же был арестован. 14 сентября следователь допросил его.
— Обвиняемый Докукин, признаете ли вы себя виновным в распространении антисоветских слухов о войне, а также в проведении антисоветской деятельности и агитации?
— Виновным в проведении антисоветской деятельности и антисоветской агитации я себя не признаю, так как антисоветской деятельности не проводил и антисоветской агитацией не занимался. Больше показать ничего не могу.
15 сентября следствие было закончено, и о. Афанасий был переведен в тюрьму в Москву.
— Кто из вашей семьи раскулачивался, лишался избирательных прав или получал твердое задание?
— Твердое задание я получил в 1932 году, с 1919 года лишен избирательных прав, в 1933 году хозяйство было раскулачено.
— Признаете вы себя виновным в проводимой вами контрреволюционной работе?
— Нет, — ответил священник.
На этом допросы были закончены. 26 сентября тройка НКВД приговорила отца Афанасия к расстрелу. Священник Афанасий Докукин расстрелян 9 октября 1937 года и погребен в общей безвестной могиле на полигоне Бутово.
