Александр Флегинский — сын священника, в 22 года, в 1883 году, окончил Ставропольскую духовную семинарию и получил место псаломщика при Казанском соборе города Ставрополя.
В том же 1883 году рукоположен во диакона, а затем — во священника и определен в клир храма мученика Лонгина сотника станицы Ключевой Кубанской области.
В 1885 году переведен в станицу Красногорскую, где занимал должность окружного миссионера, а затем окружного духовника в благочинии. Был членом Ставропольского епархиального церковно-археологического общества.
В 1908 году переведен в станицу Георгие-Афипскую и назначен благочинным 17 округа.
После захвата станицы большевистскими войсками в марте 1918 года, по населенному пункту пронеслась волна насилия и скорых расправ. В это же время схвачен и изрублен на куски красноармейцами отец Александр. Впоследствии была установлена дата смерти — 24 марта по старому стилю. Тело было найдено за пределами станицы спустя семь месяцев после убийства. Сын отца Александра смог вывезти останки в город Екатеринодар, где 18 сентября в Александро-Невском соборе при большом стечении народа и духовенства состоялось отпевание.
