Евгений Васильев — сын московского священника. Получил первоначальное духовное образование, поступил в Московскую духовную академию, но окончить её не успел, т. к. после революции она была закрыта. Продолжил обучение в частном порядке, сдавая экзамены профессорам академии.
Был рукоположен во священника и через некоторое время назначен настоятелем Успенской церкви в селе Косине Ухтомского района Московской области (ныне в черте Москвы) и помощником благочинного.
Власти несколько раз собирались закрыть церковь. Так, в феврале 1936 года (о. Евгению было 44 года) было решено в здании храма устроить зернохранилище. Однако в то время о. Евгений сумел организовать верующих, и они отстояли храм.
В 1936 году до секретного отдела НКВД стали доходить сведения об увеличении числа паломников в Успенский храм и на Святое озеро, расположенное рядом с храмом и издавна славившееся как целебное. Паломники, отслужив молебен в церкви, шли на озеро, откуда брали воду, и некоторые из них купались. Были часты случаи исцелений, о которых знали как сами верующие, так и священник. Предположив, что все это происходит благодаря активной деятельности настоятеля отца Евгения, власти решили его арестовать.
31 марта 1936 года отец Евгений был арестован и заключен в Бутырскую тюрьму в Москве. Он обвинялся в «распространении в к/р целях ложных слухов о якобы имевших место случаях чудесного исцеления на Святом озере».
— Следствие располагает данными, что вы в контрреволюционных целях распространяли ложные слухи о якобы имевших место случаях чудесного исцеления на Святом озере от различных болезней.
— Я не отрицаю, что ко мне в церковь в село Косино приезжали верующие из различных мест, служили в церкви молебны, после этого из церкви уходили на Святое озеро за водой, купались в нем с целью получить исцеление от болезней. В летнее время бывали отдельные дни, когда ко мне в церковь приезжало по 10-15 человек верующих.
Допрошенные свидетели показали, что встречали за службой в церкви в селе Косино много верующих из различных районов Московской области, которые специально приезжали к священнику Евгению Васильеву отслужить молебен и на Святом озере набрать воды, которая имеет целебную силу и помогает от всяких болезней. Верующие по окончании wерковной службы по указанию священника шли на озеро купаться, пили воду и набирали ее из озера в привезенную посуду и расходились по домам, рассказывая при этом, что они получили исцеление от болезней, которыми страдали продолжительное время.
Священник Евгений Васильев на мой вопрос, почему он дает указания верующим пить грязную воду из озера, ответил: «Что вы говорите? Это Святое озеро раньше очень почиталось верующими, на озеро приезжало много народу со всех концов, было много случаев чудесных исцелений от различных болезней, и сейчас снова верующие стали приезжать отслужить молебен, набрать воды, а некоторые выкупаться. Я лично знаю несколько человек, которые получили исцеление после купания в Святом озере. Правда, сейчас власть очень преследует за это, все приходится делать очень скрытно. В этом году немного стало проще, а то попросту поставили сторожей. До революции на Святое озеро стекалось несколько тысяч богомольцев, среди которых были различные больные, и многие по вере уходили вполне здоровыми. Так и сейчас многие в это лето, помолившись в нашем храме и выкупавшись в озере, исцелились. Вот вам доказательство того, как еще крепко народ верит в Бога... многие из них обошли все больницы и пришли сюда».
Из показаний свидетеля: «В феврале 1936 года священник Васильев пригласил меня из церкви в дом, где в моем присутствии говорил: "Коммунисты и молодежь постановили закрыть нашу церковь и засыпать ее хлебом, но я сумел организовать верующих, и мы снова отстояли наш храм. Конечно, это не надолго, но, возможно, Бог смилуется над нами, будет война, и тогда мы отмучаемся от этой проклятой власти". Верующие после окончания церковной службы и молебна по указанию священника Евгения Васильева шли на озеро — купаться, умываться, пить воду, отдельные верующие во время купания пели молитвы, плакали по выходе из озера и распускали слухи, что они исцелились от болезней, чем еще больше привлекали паломничество верующих на Святое озеро. Мне лично священник Васильев говорил, что за лето 1935 года на Святом озере было несколько случаев чудесного исцеления от болезней, и при этом привел пример двенадцатилетней девочки, дочери цыганки, которая была совершенно слепой и впоследствии получила исцеление».
2 июля 1936 года Особым совещанием при НКВД СССР священник был приговорен к трем годам заключения в исправительно-трудовом лагере.
Был выслан сначала в Мариинский лагерь в Новосибирской области, а затем в Хабаровск.
Скончался 24 ноября 1937 года в исправительно-трудовом лагере в городе Хабаровске, погребен в безвестной могиле.