Федор Каллистов — сын диакона из села Усть-Кера (Аршиновка) Нижне-Ломовского уезда Пензенской губернии. В 1880 году 15-летний Федор Каллистов окончил духовное училище, а в 1886 году — Пензенскую духовную семинарию. Затем он был определен псаломщиком в родное село.
В 1887 году после женитьбы рукоположен в диакона, а затем и в священника. В 1887-1916 годах отец Феодор служил в различных селах Пензенской губернии, занимаясь также просветительской деятельностью в качестве законоучителя церковно-приходских и земских школ, а также училищ. В семье Каллистовых родилось 14 детей.
В 1916 году священника перевели в клир соборной церкви Троицы Живоначальной города Троицк Краснослободского уезда Пензенской губернии. В том же году он потерял дочь, спустя два года — овдовел, затем умер один из его зятьев. Клавдия, дочь о. Федора, вспоминает: «У отца начались беды, умерла дочь Екатерина, которая училась в консерватории в Москве. Сдохла корова. Года через два умерла жена. Потом умер мой муж, священник Валерьян Ремизов. Федор Степанович сидел во дворе на скамейке и думал: «Господи, Отец наш, когда эти беды закончатся?» К нему подошел старец святитель отче Николай и сказал: «Этими бедами ты и жив!».
В 1922 году о. Федор был возведен в сан протоиерея.
В 1930-е годы власти делали все, чтобы закрыть церковь в Троицке. 28 февраля 1930 года священника задержали сотрудники ОГПУ. Его обвиняли в антисоветсткой и антиколхозной агитации, но он вину не признал. Прихожане составили обращение, в котором просили отпустить отца Феодора под их поручительство и подписку. Однако 3 октября 1930 года было вынесено обвинительное заключение и его приговорили к ссылке в Западную Сибирь сроком на три года. Троицкий храм был закрыт.
В 1933 году протоиерей Феодор вернулся в Троицк, открыл церковь и возобновил богослужения. На него снова стали писать лживые доносы в милицию и НКВД. В 1935 году церковь опять закрыли под предлогом неуплаты налогов государству за здание. Протоиерею Феодору удалось вновь открыть церковь и возобновить службы. С целью предотвратить новое закрытие церкви священник собрал часть суммы на уплату налога, но по очередному доносу 14 августа 1937 года был арестован. На следствии отец Феодор держался мужественно, никого не обвинял, не называл никаких имен, не признал обвинений в агитации.
22-23 августа 1937 года состоялось заседание тройки НКВД МАССР. Выписка из протокола тройки НКВД гласит: «Калистов Федор Степанович, 1865 г. р., служитель религиозного культа — протоиерей, судим за контрреволюционную деятельность. Обвиняется в активной антисоветской террористической агитации и призыве населения к борьбе против советской власти. Постановили: «Калистова Федора Степановича расстрелять».
3 сентября 1937 года протоиерей Феодор Каллистов принял мученическую кончину.