Федор Яковлев — сын крестьянина, происходит из Санкт-Петербургской губернии. Окончил 7 классов Воронежского реального училища. Обучался на физико-математический факультете университета, а также учился в сельскохозяйственном институте, успешно занимался научной работой.
После Октябрьского переворота был мобилизован в Красную армию, затем служил в милиции, в губернском продовольственном комитете.
В самый разгар гонений на церковь был рукоположен в сан священника. Служил во Владимирской церкви, а затем в Акатовом монастыре города Воронежа.
В 1930 году 33-летний отец Феодор был арестован вместе с духовенством Акатова монастыря. Виновным себя в предъявленных ему обвинениях не признал.
28 июля 1930 года осуждён по групповому делу «Дело епископа Алексия (Буя). г. Воронеж 1930 г.» и приговорён к расстрелу.
Расстрелян 2 августа 1930 года в 22 часа вечера близ Воронежа вместе с другими осужденными: архимандритом Тихоном (Кречковым), иеромонахами Георгием (Пожаровым), Космой (Вязниковым), свящщ. Иоанном Стеблиным-Каменским, Александром Архангельским, Сергием Гортинским и Георгием Никитиным, мирянами Евфимием Гребенщиковым, Петром Вязниковым и Марком Тымчишиным.