Иван Кесарийский был сыном священника, окончил духовную семинарию и в 1903 году, 25 лет, — Московскую духовную академию. В 1904 году он был рукоположен в сан священника и служил в храмах Московской епархии, в последнее время — в храме Владимирской иконы Божией Матери в селе Быково.
Допросы начались в день ареста, 1 ноября 1937 года. Следователь спрашивал, с кем священник знаком. Отец Иоанн отвечал, что знает служащего с ним священника и диакона, старосту храма и некоторых членов церковного совета, с которыми если встречался и беседовал, то исключительно на церковные темы.
— Вы один из организаторов церковной группы в селе Быково, назовите, кто входит в состав данной группы.
— Это мне неизвестно, и организатором группы я не являюсь.
— Где происходили нелегальные собрания контрреволюционной группы церковников села Быково?
— Это мне неизвестно, так как на нелегальных собраниях я не присутствовал.
Следователь потребовал от священника, чтобы тот признал себя виновным в том, будто он обсуждал вопрос о совершении террористического акта против председателя колхоза. Священник это обвинение отверг.
— Известно, что вы распространяли клевету о советской власти и колхозах. Подтверждаете вы это?
— Контрреволюционной клеветы о советской власти я никогда не высказывал и не распространял. Меня могли неправильно понять, когда я однажды в церковной сторожке за чаем рассказывал случай, о котором было напечатано в газете, как в один колхоз приехал председатель райисполкома, зашел на конюшню, увидел худой хомут, надел его на шею колхознику и сказал: «Вы раньше ходили в хомуте и теперь будете ходить в хомуте». Причем этот случай я рассказал как случившийся факт, без всякой клеветы на колхозы.
— Дайте показания о контрреволюционной деятельности каждого участника контрреволюционной группы церковников села Быково.
— О контрреволюционной деятельности церковников села Быково мне неизвестно, и участников данной группы я не знаю.
15 ноября 1937 года Тройка НКВД приговорила священников Иоанна Кесарийского, Петра Косминкова и диакона Симеона Кречкова к расстрелу. Они были расстреляны 16 ноября 1937 года и погребены в безвестной общей могиле на полигоне Бутово.