Иван Янушев — сын московского диакона, в 1897 году, будучи 20 лет, окончил Московскую духовную семинарию и поступил в Казанскую духовную академию, которую окончил в 1902 году. В 1903 году поступил псаломщиком в Архангельский собор Московского Кремля. С 18 мая 1908 года — священник Спасского собора Москвы.
22 сентября 1917 года был перемещен в Благовещенский собор Кремля, а 7/20 мая 1918 назначен исполняющим обязанности сакеллария (хранителем ризницы) этого собора. После закрытия советской властью всех кремлевских соборов и монастырей был назначен настоятелем храма в честь святителя Спиридона Тримифунтского на Спиридоновке, за Никитскими воротами. В этом храме отец Иоанн служил до его закрытия и разрушения.
В 1920 году был удостоен сана протоиерея. 1 августа 1930 года был назначен служить в храм Рождества Христова, что в Палашах.
В 1935 году был назначен в храм Успения Пресвятой Богородицы в поселке Вешняки (ныне район Москвы).
19 ноября 1937 года был арестован.
— В Царской армии служили?
— Нет.
— Вы были судимы?
— Да, я судился в 1937 году за крещение ребенка без согласия родителей и присужден к одному году принудительных работ. Кассационная коллегия меня оправдала.
— Следствие располагает материалом, который вас изобличает как контрреволюционера, ведущего пропаганду против существующего советского строя. Признаете ли это?
— Нет, я это не признаю.
— Следствие от вас требует искренних показаний о вашей контрреволюционной деятельности, дайте по этому вопросу показания.
— Я контрреволюционной деятельности никакой не проводил.
— В предъявленном вам обвинении виновным себя признаете?
— Виновным себя не признаю.
Лжесвидетели рассказали следствию, что знают отца Иоанна как человека, настроенного антисоветски. Одна свидетельница показала, что в сентябре 1937 года будто бы беседовала с ним около станции Вешняки. Речь зашла о конституции, по поводу которой священник сказал: «Конституция написана красивыми фразами, коммунисты только и способны писать красивые декларации и кричать на каждом углу о всеобщих выборах, о демократии, о признании свободной религии. А те же коммунисты закрывают церкви, на каждом шагу выступают против верующих и не дают возможности отправлять религиозные обряды, родителям не дают возможности крестить младенцев, а окрестишь, так осудят. Это не жизнь, а гонение на православных. Пышными фразами конституция написана для того, чтобы заслужить доверие среди народа, которого коммунисты не имеют. Но все равно коммунистам, гонителям православных, с их конституцией скоро придет конец».
1 декабря 1937 года тройка НКВД по Московской области приговорила отца Иоанна к расстрелу за «ведение контрреволюционной агитации и высказывания террористическх настроений в отношении руководителей ВКП(б) и советского правительства».
8 декабря 1937 года о. Иоанн Янушев расстрелян на полигоне в Бутово.