Иван Заболотный родом из деревни Клиново Одесского уезда Херсонской губернии, до 18 лет (до 1917 года) Иван проживал в родной деревне, зарабатывая работой по найму, а в 1918 году он был призван в Красную Армию. Но служить не хотел и стал скрываться от военной службы.
В 1919 году Ивана Заболотного арестовывали и обвиняили в дезертирстве из Красной армии. Приговор: заключение в концлагере. С начала 1920 года по июнь 1922 Иван Заболотный содержится в концентрационном лагере в Одессе.
После выхода на свободу он поступил послушником в монастырь Уманского уезда Киевской губернии и подвизался в нем около 5 лет. Когда в 1927 году монастырь закрыли, послушника Иоанна рукоположили в священника.
С 1922 по 1927 г. я был монахом в монастыре, после чего был попом до июля 1935 г. В 1935 г. прибыл в Зарайск и служил попом, свидетельствовал он перед следователями в июле 1937 г. Обвинение, на основании которого был произведен арест, не отличалось оригинальностью — отцу Иоанну Заболотному была инкриминирована «контрреволюционная деятельность». Были и «свидетели», которые дали следующие «показания»:
— В феврале месяце 1937 года Заболотный в беседе по вопросу расстрела врагов народа говорил, что большевики варвары. Самых лучших людей уничтожили...
— В марте месяце 1937 года Заболотный среди населения проявлял свое недовольство к Советской власти, говорил, что Советская власть и коммунисты на бумаге расписывают хорошо, а на деле не выполняют. Новая конституция положения в стране не изменит и народу жить будет не лучше, они расстреливают и томят в тюрьмах.
— В июне месяце 1936 года во время подписки на заем среди населения Заболотный высказывался против подписки на заем и говорил, что не знаю, за что помогать Советской власти, она у нас жизнь отняла и лишает нас прав гражданства, так за что же нам помогать Советской власти, она привыкла народ грабить, одними налогами крестьян задавила, а теперь путем выпуска займа последние гроши выколачивает, это не власть, а настоящая грабиловка!
Виновным себя отец Иоанн не признал. 27 ноября 1937 года тройка УНКВД по Московской области приговорила священника Ивана Заболотного к высшей мере наказания. 3 декабря 1937 года он был расстрелян на Бутовском полигоне.