Николай Заболотский — сын священника Воскресенской церкви города Вязьмы. Учился в Московской и Вифанской семинариях, затем в Юрьевском университете. В 1910 году, 34 лет от роду, рукоположен в иерея, служил в храмах Смоленской губернии. В 1930-е годы отец Николай был возведен в сан протоиерея и назначен благочинным Уваровского района Московской области. В это время он жил в церковной сторожке в селе Некрасово.
В 1937 году на священника был написан донос, что он не спрашивает разрешения местных властей для совершения церковных таинств и треб. Были собраны и другие показания, и 19 ноября 1937 года отец Николай был арестован. Из обвинения: «Находясь в деревне Жихарево, распространял контрреволюционную клевету против Советской власти и ВКП(б)... Вел среди населения активную антисоветскую агитацию против существующего строя...» Отец Николай признал, что действительно был в мае 1937 года в деревне Жихарево, куда был приглашен для крещения ребенка. Виновным в антисоветской агитации, контрреволюционной деятельности и других подобных обвинениях себя не признал.
После окончания следствия протоиерей Николай Заболотский был переведен в тюрьму в Москву и вскоре расстрелян на полигоне в Бутово.