Пантелеимон Богоявленский родился в начале 1880-х годов в городе Великие Луки Псковской губернии в семье псаломщика. В 1903 году окончил Псковскую духовную семинарию и был назначен псаломщиком в Никольский храм Александровского Посада Псковской губернии. 3 июля 1907 года был рукоположен во диакона ко храму великомученика Георгия Победоносца погоста Сенно той же губернии. 30 сентября 1908 года рукоположен во священника ко храму Казанской иконы Божией Матери Воронцовского Благовещенского женского монастыря.
Летом 1911 года был направлен служить в храм в селе Верхний Остров, а осенью — в храм святителя Николая в погосте Карачуницы Порховского уезда, где тщанием помещика Вячеслава Лопухина при храме был устроен инвалидный дом. В том же году он был назначен вторым священником Троицкого собора в городе Порхове.
В 1912 году на съезде священников, депутатов Порховского духовно-училищного округа, отца Пантелеимона избрали кандидатом в члены правления Порховского духовного училища на три года, с 1913 по 1915 год. С 1915 года был членом Ревизионного комитета Порховского духовного училища.
Вел широкую пастырскую и просветительскую деятельность. Имея талант проповедника, старался проповедовать как можно чаще.
В сентябре 1918 года отец Пантелеимон за произносимые им проповеди был арестован Псковской губернской чрезвычайной комиссией и расстрелян. Точная дата его убиения и место погребения не установлены. В архивах не сохранилось материалов его следственного дела. Документов, которые содержали бы подробности обстоятельств его гибели, обнаружить не удалось.
