Сергей Руфицкий — сын священника о. Михаила села Ельцино Владимирской губернии. Четверо сыновей о. Михаила, в том числе Сергей, окончили Владимирское духовное училище и Владимирскую духовную семинарию и стали священниками. В советское время все они приняли мученическую кончину.
Сергей окончил семинарию 20 лет, в 1904 году, а в 1907 году был рукоположен во священника и направлен служить в храм села Седиково Владимирской губернии Ковровского уезда. Когда в 1919 году овдовела его сестра, муж которой — настоятель храма Тихвинской иконы Божией Матери села Ивановское — наследовал это место у их отца священника Михаила Руфицкого, умершего в 1896 году, о. Сергий был переведён в этот храм, и заботы о содержании сестры легли на его плечи. Здесь он служил до своего ареста в 1937 году.
Был скромным, трудолюбивым и отзывчивым; занимался садоводством и пчеловодством. Очень любил детей и с удовольствием с ними занимался чтением книг, работой по хозяйству, прививал любовь к природе.
По воспоминаниям прихожан, примерно в 1930 году всем клирикам храма власти предложили публично отречься от веры. Настоятель храма протоиерей Сергий Руфицкий и псаломщик Дмитрий Рудаков категорически отказались. На сделку с властями пошёл диакон храма Николай: в клубе перед сельчанами он «покаялся», что обманывал их, ему обрезали длинные волосы и после этого он немедленно уехал из села.
По воспоминаниям прихожан, в 1933–34 годах с колокольни храма сбросили колокола. Самый большой колокол упал и не разбился, и его потом добивали его же «языком». Сразу после этого отец Сергий начал ремонт колокольни.
17 ноября 1937 года вечером после всенощного бдения священника и псаломщика арестовали. Очевидцы говорят, что, прежде чем сесть в «воронок», они перекрестились на храм и поклонились присутствующим односельчанам.
19 ноября 1937 года состоялся единственный допрос.
— Обвиняемый Руфицкий, следствие располагает данными, что вы... проводите антисоветскую агитацию. Подтверждаете ли вы это?
— Я это отрицаю, никакой антисоветской агитации я не проводил и не занимался.
Обвинений в контрреволюционной деятельности и антисоветской агитации о. Сергий не признал.
21 ноября Тройка НКВД по Московской области по ст. 58-10 УК РСФСР приговорила о. Сергия Руфицкого и псаломщика Димитрия Рудакова к расстрелу за «контрреволюционную агитацию».
27 ноября 1937 года о. Сергий Руфицкий расстрелян и погребён в безвестной общей могиле на полигоне Бутово.