Василий Ситников окончил три класса духовного училища и с 35 лет, с 1885 года, служил псаломщиком.
В 1898 году был рукоположен во диакона и служил сначала в Иоанно-Предтеченской церкви в селе Изъедугинском Шадринского уезда Екатеринбургской епархии, а затем в храме Рождества Богородицы в селе Бакланское того же уезда.
5 ноября 1913 года он был переведен в Николаевскую церковь села Далматова Пермской губернии.
В 1918 году, после того как священники Владимир Сергеев и Александр Сидоров были арестованы, диакон Василий стал укорять безбожников за разграбление имущества арестованных пастырей. Они отметили это и отомстили. Диакон Василий Ситников был убит на следующий день после мученической кончины служивших вместе с ним пастырей — 11 июля 1918 года.