будущее есть!
  • После
  • Конспект
  • Документ недели
  • Бутовский полигон
  • Колонки
  • Pro Science
  • Все рубрики
    После Конспект Документ недели Бутовский полигон Колонки Pro Science Публичные лекции Медленное чтение Кино Афиша
После Конспект Документ недели Бутовский полигон Колонки Pro Science Публичные лекции Медленное чтение Кино Афиша

Конспекты Полит.ру

Смотреть все
Алексей Макаркин — о выборах 1996 года
Апрель 26, 2024
Николай Эппле — о речи Пашиняна по случаю годовщины геноцида армян
Апрель 26, 2024
«Демография упала» — о демографической политике в России
Апрель 26, 2024
Артем Соколов — о технологическом будущем в военных действиях
Апрель 26, 2024
Анатолий Несмиян — о технологическом будущем в военных действиях
Апрель 26, 2024

После

Смотреть все
«После» для майских
Май 7, 2024

Публичные лекции

Смотреть все
Всеволод Емелин в «Клубе»: мои первые книжки
Апрель 29, 2024
Вернуться к публикациям
Организация науки и образования в других странах мира
Июль 12, 2025
Наука
Демина Наталия

Вдохновленный геномикой

Вдохновленный геномикой
steve_obrien_lomonosov
Открытие Центра геномной биоинформатики им. Добжанского в СПбГу проходило в прекрасном Петровском зале. Профессор Стив О'Брайен возле бюста Ломоносова. Источник: Н. Деминой

Наша беседа с известным биологом Стивом О'Брайеном (Stephen James O'Brien), научным руководителем Центра геномной биоинформатики им. Добжанского в СПбГу, проходила на конференции, давшей старт началу работы его центра. Стив стал один из победителей второго конкурса мегагрантов 2011 года. Тогда еще не было известно о том, что Правительство РФ решило профинансировать наиболее успешные проекты мегагрантов первой и второй волны и была большая неопределенность в том, как же дальше будут развиваться созданные Лаборатории. Беседовала Наталия Демина. 

См. также:

  • Лекция Павла Певзнера «Персональная медицина и ассемблирование геномов: пазл с миллиардом частей» (24 мая 2012 г.) Видеозапись онлайн-трансляции

Почему вы решили участвовать в российском конкурсе мегагрантов?

Мой друг, биолог Андрей Козлов, номинировал меня на этот конкурс, так как считал, что мой бэкграунд достаточно широк и у меня есть большие шансы на победу. И я, особо в тот момент не задумываясь, почел за честь принять участие в конкурсе. Когда он меня попросил подготовить заявку на грант, я провел несколько дней в раздумьях, чтобы я стал делать, если бы имел возможность создать новую лабораторию без всяких ограничений, которые у меня были, когда я работал на госслужбе США в течение стольких лет (ученый в 1986-2011 гг. был директором лаборатории геномного разнообразия Национального института рака США – «Полит.ру»).

Когда я узнал, что оказался в числе победителей в октябре 2011 года, у меня были смешанные чувства, так как я работал на одном месте 40 лет. Я понимал, что не смогу совмещать и руководство проектом, и свою работу на правительство США. Однако у меня уже была возможность уйти на пенсию, и я люблю вызовы судьбы, так что этот проект показался мне хорошей возможностью использовать опыт моей работы, моей жизни, моих друзей, всех тех, кто согласился приехать в Санкт-Петербург.

Мне также казалось важным использовать культурный и общественный потенциал россиян, которым политические трудности не позволяли добиться научных успехов.

Всем нам известен пример Китая, который за 25 лет сумел занять лидирующие роли и в экономике и науке. Я думаю, что и у России есть потенциал, если политическая воля будет помогать, а не мешать развитию науки.

Как малая часть этого процесса, я приехал в Россию, чтобы попытаться собрать небольшую команду исследователей, чтобы обучить молодых ребят геномике, а это большая область науки, и чтобы завести новых друзей. Здесь есть потенциал для исследований в области медицины человека, естествознания (natural history), сохранения биоразнообразия и других. Я восхищен тем, как продвигается наша работа. 

Сталкивались ли вы с какими-то бюрократическими и прочими препятствиями, которые затрудняли вашу работу по проекту?

Конечно, да. Но всегда есть пути их преодоления. Если сказать честно, то в США я сталкивался с куда более сложными бюрократическими проблемами при изучении генома человека и видов, находящихся под угрозой исчезновения.

Я работал в разных странах мира, в Африке, Индии, Австралии и Китае. И везде были свои возможности и свои проблемы. Если у тебя есть терпение, то рано или поздно ты найдешь людей, которые загораются твоими идеями и которые могут помочь. И эти люди знают, как преодолеть бюрократические проблемы. Так что я надеюсь, что если я немного выучу русский, прочитаю книги об истории России, и буду слушать своих коллег, то пойму, как бороться с трудностями в России.

Но наука – потрясающий объединитель (a terrific unifier),

ученые в любой стране заинтересованы в поиске истины, они не знают ответов, но они ищут истину.

Они хотят двигаться в неизведанные земли, где никто не был, и они это делают, невзирая на политические проблемы, которые создаются властью.

Я сотрудничал с Алексеем Козловым, начиная с конца 1970-х годов, несмотря на все турбулентности. Я работал с моими китайскими коллегами в течение 30 лет, пройдя через все сложные годы. Я работал с моими американскими коллегами, преодолевая трудности (смеется).

В общем и целом, наука – это приятное занятие, потому что люди, которые ею занимаются, обладают большим сердцем, придумывают потрясающие идеи и они открыты новому.

Они хотят помочь обществу, они хотят изменить мир к лучшему и они готовы начинать с нуля.

И не важно, какой человек национальности.

Санкт-Петербург – прекрасный город с потрясающей историей, Эрмитаж и Нева радуют глаз. Я потрясен этим зданием двенадцати коллегий, в котором Петр I планировал разместить свои министерства. Так что для меня – всё это как приключение в неизведанную часть мира.

Где будет находиться ваша лаборатория? Сколько человек будут в ней работать?

СПбГУ выделил нам площади в здании Химического факультета на Васильевском острове. Это небольшая площадь 400-500 кв. м., у нас там будет 15-20 молодых сотрудников в течение двух лет, что отвечает условиям гранта. Но кроме этого, к нам будут приезжать коллеги из других стран. Мы также планируем найти дополнительные ресурсы. У российских мегагрантников много денег, но их недостаточно, чтобы основать центр такого же уровня как BGI (Beijing Genomics Institute, один из ведущих мировых центров по секвенированию геномов – «Полит.ру») в Китае или Sanger Institute в Кембридже (один из ведущих центров в проекте «Геном человека» - «Полит.ру»).

Я думаю, что в России есть ресурсы, которые можно собрать вместе, чтобы создать конкурентоспособный научный центр в области генетики, возможно, с коллаборацией с кем-то еще или может быть с помощью частных инвесторов и филантропов. Мы знаем, что в России есть миллиардеры. На что они хотят потратить деньги? Может быть, кому-то будет интересно потратить их на открытие «книги жизни», на то, чтобы понять, почему геномика столь увлекательна?

Вы собираетесь встретиться с ними и поговорить?

Я попытаюсь.

Почему вы решили стать биологом? Ваши родители – ученые?

Нет. Мой отец был радиоинженером, он создавал радио и телестанции, всё то, что было гордостью науки и техники XX века.

Мое решение стать ученым было третьим в моем списке приоритетов. Первым приоритетом было стать профессиональным игроком в бейсбол, вторым – певцом и танцором на Бродвее. Но тот и другой путь требовали редкого качества, а именно таланта. А я был хорош в науке и сказал себе: «Это – моё». У меня не было таланта стать профессиональным спортсменом…

А почему биология, а не, скажем, физика или математика?

Я думаю это потому, что в студенческие годы я восхищался продвижением биологии в тайны гена, и тем, что делал Феодосий Добжанский и его современники.

Вы встречались с Добжанским лично?

О да, он был одним из моих учителей!

Работа Добжанского служила источником вдохновения для всего моего поколения ученых.

Но к тому времени, когда я поступил в аспирантуру, ему было 60 (Ф. Добжанский – российско-американский генетик, один из основателей синтетической теории эволюции, род. в 1900, в 1927 г. уехал на учебу в США, умер в 1975 – «Полит.ру»). Мой профессор был его учеником, я встречался с ним несколько раз, мы много разговаривали. Я очень хотел быть его аспирантом, но бюрократические проблемы в том месте, где он работал, не позволили мне это сделать. Я закончил небольшой колледж, который был недостаточно известен, чтобы меня приняли в ту аспирантуру. Так что когда мы с ним встретились потом, он мне сказал: «Стив, тебе просто надо было написать мне напрямую!» - и он бы меня взял.

Вот почему вы выбрали его имя для своего центра.

Я взял его имя, т.к. хотел, чтобы центр носил имя того, кем Санкт-Петербургский университет мог бы гордиться. Он ведь начинал свои научные исследования здесь. Он переехал в США, и он – знаменитый эволюционный биолог и популяционный генетик. Фактически он был отцом-основателем эмпирической и экспериментальной популяционной генетики. Когда он начинал свои исследования, эти области были в самом зародыше, он их развил. Это были области биологии, которые другие исследователи тогда не очень уважали, они думали, что гораздо важнее изучать работу генов, чем изучать мух, которые летают в пустынях или вокруг деревьев. Но Добжанский был заворожен процессами эволюции - и с тех пор популяционная генетика, которую он начал, развилась в три области, в которых мне повезло работать.

Во-первых, только благодаря инструментам, которые были разработаны популяционными генетиками, стали возможными открытия в области генома человека. Исследования по открытию новых генов, в области СПИДа, рака и других сложных болезней, вышли из подходов популяционной генетики.

Во-вторых, это судебно-медицинская экспертиза, идентификация ДНК при обвинениях в убийствах и в изнасилованиях. Присяжные требуют проведения тестов ДНК, а они все базируются на статистической популяционной генетике.

В-третьих, это сохранение биоразнообразия. Треть видов, которые существуют на Земле, находятся под угрозой исчезновения. Понимание истории этих видов базируется не всегда, но нередко на генетических исследованиях. И эти генетические исследования считаются важным пунктом любой программы по сохранению популяции исчезающего вида.  

Мне повезло участвовать во всех трех областях исследований, они все начались с популяционной генетики.

Как будет проходить ваше сотрудничество с Павлом Певзнером и его лабораторией?

Павел пришел к геномике с опытом работы в computer science. Я пришел к этому из биологии. Но разными путями мы дошли к одной точке – мы оба восхищены достижениями и возможностями секвенирования геномов. Так что мы решили организовать формальное партнерство с Павлом Певзнером, возглавляющим Лабораторию алгоритмической биологии, и Андреем Козловым, возглавляющим Биомедицинский центр. И мы втроем объединим наши экспертные возможности и разработаем совместную программу исследований, которая будет лучше той, которую любой из нас мог бы придумать поодиночке.

Мы надеемся, что молодые ученые, постдоки, смогут получить знания и опыт в этих трех областях, которые сделают их конкурентоспособными и на уровне лучших достижений наших областей науки.

Собираетесь ли вы продолжить работу центра по истечении двух лет гранта, для чего будете искать деньги для этого? Это ваша надежда или какие-то веские основания рассчитывать на то, что вы эти деньги найдете?

Это моя цель, и это цель Павла и цель Андрея. Мы будем работать вместе, чтобы создать успешно работающий научный центр. Кроме нас есть еще и Александр Графодатский из Новосибирска (из Института химической биологии и фундаментальной медицины г. Новосибирска – «Полит.ру»), который делал доклад на конференции и его коллег. И Ольга Уфыркина из Владивостока (из Институт биологии и почвоведения, Дальневосточное отделении РАН – «Полит.ру»). Мы планируем сотрудничать с петербургскими генетиками, такими как Сергей Инге-Вечтомов.

Многие коллеги  уже согласились работать с нами в единой команде в виртуальном центре, который имеет разные «дома».

Так получилось, что я буду работать здесь, но мы все будем работать на единую цель.

Это будет неформальный центр?

Да, неформальный виртуальный центр.

Вы собираетесь жить здесь в Санкт-Петербурге в течение многих месяцев?

По требованиям гранта, я должен быть здесь минимум 4 месяца в году. А на самом деле, возможно, я буду здесь даже больше. В то же время я должен бывать и в США, хотя я выполнил обещание и ушел на пенсию, но у меня есть ученики-постдоки, которые нуждаются в моем внимании, у меня есть приглашения из Гарварда, из Смитсоновского института, из Пекинского университета в Китае, которыми я надеюсь воспользоваться  в следующие несколько лет. Я постараться также привлечь коллег к сотрудничеству. Наша лаборатория – это на самом деле международное предприятие.

В коридоре я поговорила с участниками конференции после доклада китайского коллеги Yang Huanming (Dr. Henry Yang) из BGI (Пекинского института геномики). Они сказали: «Что же мы будем делать через 10 лет? Китай заберет все секвенирование в свои руки». Что вы думаете о будущей роли американской или европейской науки в свете развития науки в Китае? Вы боитесь наступления китайской науки? 

Нет, я очень рад и восхищен тем, что делают китайцы. Они очень открыты, они заняли ведущие роли в обмене данными (data-sharing). Они заинтересованы в том, чтобы сделать наш мир лучше, потому что они – ученые. Они сначала ученые, а потом уже китайцы. Они прекрасно освоили технологию секвенирования, и уже многое сделали на этом пути. 

Но они были в таком же положении, в каком сейчас находится российская наука 20 лет назад. Их было мало, Генри Янг был одним из них, Генри работал в своем гараже с аппаратом по секвенированию, который он едва мог себе позволить, и его дело начало развиваться.

Я думаю, что

то, чего достигли китайцы – превосходно, и то же самое может произойти и в России.

Вам нужна поддержка и открытость (openness) со стороны правительства и частного сектора и академического сообщества. 

Участвовали ли вы во встрече ученых-мегагрантников с президентом Медведевым? 

Я был приглашен на эту встречу, но не мог приехать. Но я был бы рад встретиться и с президентом России, и с министром науки. Но я думаю, что самое важное – дать возможность талантливым молодым ученым заниматься наукой переднего края, которой и мне повезло заниматься. 

Общаетесь ли вы с другими получателями мегагрантов, обмениваетесь ли опытом? 

Да, конечно. Мы обсуждаем разные вещи, обычно они рассказывают о том, что им не нравится (смеется), а я предпочитаю говорить о том, что мне нравится. 

Я нахожусь здесь и вижу потенциальные возможности и рад тому, что многие мои друзья приехали сюда, а другие мои друзья (у меня их много) собираются приехать в Санкт-Петербург. Они хотят посмотреть на наш центр и помочь ему. 

И последний вопрос. Каким бы вы хотели видеть ваш центр через 10 лет? 

Я надеюсь, что это будет самостоятельный центр (self-standing), куда российские ученые и студенты будут приходить, чтобы получить подготовку в области геномики у российских исследователей и ведущих ученых. А моя фотография будет на стене - как одного из тех, кто создал этот центр, но им будет руководить россиян, подходящий для этой роли. 

Т.е. вы не собираетесь оставаться главой этого центра через 10 лет? 

Я надеюсь, что нет. Я хочу, чтобы этим занимались молодые люди. Я буду рад оставаться сотрудником этого центра через 10 лет, но не хочу быть его главой. Потому что

в моей ДНК – гены ученого, а не администратора, и прямо сейчас я пытаюсь свести все вместе, чтобы это заработало.

Однако за свою жизнь я понял один секрет – не требуется много времени на то, чтобы научить молодых людей всему тому, что я знаю.  Может быть, несколько недель или месяцев. А потому они начинают вести дела даже лучше, чем я. Я должен быть готов к тому, чтобы начать учиться у них. 

Демина Наталия
читайте также
Наука
Леонид Костандов: 1915 – 1984
Ноябрь 27, 2015
Руссо Максим
Наука
Сила самоиронии. К 80-летию Юрия Левады. Рассказывают Теодор Шанин и Борис Юдин
Май 13, 2010
ЗАГРУЗИТЬ ЕЩЕ

Бутовский полигон

Смотреть все
Начальник жандармов
Май 6, 2024

Человек дня

Смотреть все
Человек дня: Александр Белявский
Май 6, 2024
Публичные лекции

Лев Рубинштейн в «Клубе»

Pro Science

Мальчики поют для девочек

Колонки

«Год рождения»: обыкновенное чудо

Публичные лекции

Игорь Шумов в «Клубе»: миграция и литература

Pro Science

Инфракрасные полярные сияния на Уране

Страна

«Россия – административно-территориальный монстр» — лекция географа Бориса Родомана

Страна

Сколько субъектов нужно Федерации? Статья Бориса Родомана

Pro Science

Эксперименты империи. Адат, шариат и производство знаний в Казахской степи

О проекте Авторы Биографии
Свидетельство о регистрации средства массовой информации Эл. № 77-8425 от 1 декабря 2003 года. Выдано министерством Российской Федерации по делам печати, телерадиовещания и средств массовой информации.

© Полит.ру, 1998–2024.

Политика конфиденциальности
Политика в отношении обработки персональных данных ООО «ПОЛИТ.РУ»

В соответствии с подпунктом 2 статьи 3 Федерального закона от 27 июля 2006 г. № 152-ФЗ «О персональных данных» ООО «ПОЛИТ.РУ» является оператором, т.е. юридическим лицом, самостоятельно организующим и (или) осуществляющим обработку персональных данных, а также определяющим цели обработки персональных данных, состав персональных данных, подлежащих обработке, действия (операции), совершаемые с персональными данными.

ООО «ПОЛИТ.РУ» осуществляет обработку персональных данных и использование cookie-файлов посетителей сайта https://polit.ru/

Мы обеспечиваем конфиденциальность персональных данных и применяем все необходимые организационные и технические меры по их защите.

Мы осуществляем обработку персональных данных с использованием средств автоматизации и без их использования, выполняя требования к автоматизированной и неавтоматизированной обработке персональных данных, предусмотренные Федеральным законом от 27 июля 2006 г. № 152-ФЗ «О персональных данных» и принятыми в соответствии с ним нормативными правовыми актами.

ООО «ПОЛИТ.РУ» не раскрывает третьим лицам и не распространяет персональные данные без согласия субъекта персональных данных (если иное не предусмотрено федеральным законом РФ).